密西西比州立大学是密西西比州最大的大学和旗舰研究机构。其前身为密西西比州农业及机械学院大学。

其由密西西比立法机关于1878年2月28日创立，来满足在农学、园艺学和机械艺术的培训需求。1932年立法机构将它重命名为密西西比州立学院，包括农学实验中心（1887）、工程学院（1902）、农学学院（1903）、工业教学学院（1909）、基础科学学院（1911）、工商学院（1915）、继续教育分部（1919）。此外，在1926年学院通过了学院和学校南部联盟的第一次评审。

1958年立法机构再次将其更名为密西西比州立大学。研究生办公室成立于1936年，1951年开始授予博士学位。1954年森林资源学院成立，1956年，艺术和科学学院创立。1973年建筑学院录取了第一名学生。1977年兽医学院开课。会计学院成立于1979年。